其中A类硅胶带负电荷的残留硅羟基，而且酸性表面上金属含量高(硅羟基的pKa低)，从而导致碱性化合物较易发生拖尾。

而B类硅胶由于金属含量低，硅羟基pKa高，碱性化合物不易发生拖尾。

而自1990以后用来制作色谱柱固定相填料的硅胶颗粒已经全部采用B型硅胶。

事实上针对硅胶表面的金属离子，供应商最有效的方案是进行酸洗。

有案例显示硅胶在化学改性前如用强酸处理，可以去除高达1/3的金属离子杂质。