衬管是色谱仪进样体系的中心元件，样品在此蒸发而成气体。
选择衬管应考虑的因素包括：进样口类型/进样技术、衬管体积、衬管处理或去活及特殊性能（石英棉、石英杯、细径锥等）。
要使用去活化的衬管及玻璃棉，因为进样口衬管上的活性点可以吸附样品组分，引起色谱峰拖尾，损失灵敏度和重现性。当不分流进样及分析稍有极性的化合物时，应建议用去活化的衬管。
使用玻璃棉作用如下：
A.减少热歧视，为样品完全挥发提供足够的表面积
B.捕获非挥发组分和隔垫碎屑，使其不至于进入色谱柱
C.擦净自注射器针头上的样品，从而提高了重现性，避免样品在隔垫上的残留。
使用去活不带玻璃棉衬管的化合物有：酚类、有机酸类、农药类、胺类、滥用药物、反应性极性化合物、热不稳定化合物。
衬管需要定期更换，衬管是否需要更换主要取决于以下情况：对比以前做的谱图；样品的洁净程度；色谱峰是否出现异常现象如出现鬼峰、峰形变化、重现性差、样品高温分解等。
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