概述
环境监测中的生物监测主要分成两大类。一类是对生态系统中的现存的各类生物进行鉴定分析，以了解水体的污染情况（如水中细菌、藻类监测等），即生物生态监测；另一类是以某些特定培养的生物为受试生物，去检测水体中对生物有害的毒物含量，即生物毒性检测。
本文主要介绍环境监测生物生态实验室的监测项目和仪器配置。
一、生物生态监测
1、水体细菌学测定
主要是细菌总数、粪大肠菌群，是环境监测的常规项目，当然有些时候还会要求做一些病原微生物的鉴定（主要包括是细菌培养、生化试验、血清学试验等）。
需要的仪器设备也比较简单，主要是生化培养箱、超净工作台、高压灭菌锅。当然有条件最好有正规的无菌室，可以添置大肠菌群快速测定仪。
2、水生生物群落监测
2.1 藻类监测
藻类监测在太湖蓝藻发生后越来越受到重视，在整个生物监测实验室中属于重点分析、研究项目。藻类监测的目的主要有2个，一是通过对水体中藻类群落进行分析，通过特定藻种对污染物的指示作用，反应水体污染情况；二是水华监测、预警与控制。目前环境部门的监测主要还是集中于水华监测、预警与控制上。
水华的监测的重点和难点就是藻类的鉴定和计数。目前主要由两大类方法：传统的形态学鉴定和分子生物学鉴定。形态学鉴定中使用的仪器主要是显微镜、流式细胞仪，而分子生物学鉴定中主要用PCR。此外还会用到叶绿素测定仪、光照度计、水质多参数仪等一些辅助参数仪器。
水华的相关研究，比如水华如何预测、如何控制等，主要用到细胞破碎仪、振荡器、离心机、光照培养箱、低温冰箱、接种及暂时培养中的藻类工作台—超净台等辅助设备。
2.2 其他水生生物监测
其他水生生物监测一般从就是生物群落分析中获取环境对生物群落影响的信息。如浮游动物、着生动物、底栖生物、潮间带生物等。这类生物鉴定一般都是用形态学分析。主要仪器配置是解剖镜，淡水浮游动物中的轮虫和原生动物还需要用显微镜。
二、生物毒性监测
生物毒性监测是利用特定生物对不同浓度不同毒性的环境毒物的不同反应强度来评价环境毒物对生物的毒性作用。
生物毒性监测在水体毒性测试中用的比较多的是急性毒性测试，按照其受试生物的不同又可分成发光菌急性毒性测试、藻类急性毒性测试、蚤类急性毒性测试、鱼类急性毒性测试（斑马鱼、青鳉鱼等）、小鼠急性毒性测试等。
仪器配备：
a. 发光菌急性毒性测试：发光菌急性毒性测试系统，也可以买个便携式荧光光度计做。
b. 藻类急性毒性测试：光照培养箱是必备的，计数可以用显微镜，还能叶绿素分析仪，有时还能用光度计。
c. 蚤类急性毒性测试&鱼类急性毒性测试：如果只是测测半致死剂量，数个数就行，不用仪器，如果要提高精度，可以使用水质生物安全预警系统。
d. 小鼠急性毒性测试：严格按照标准建造的无菌室，需要有合理的布局和气流组织。
三、其他
除了上述两类外，其实还有生物危害性监测（姐妹染色单体交换（SCE）试验、蚕豆根尖微核试验）、二噁英检测（利用离体大白鼠肝癌细胞的EROD诱导指示二恶英的复合毒性效应的方法）
（内容参考仪器信息网）
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